Interjööri poolel on Toyota mudelile loonud lihtsa, kuid omapärase disainiga salongi, mis seob võrdlemisi kasutajasõbralikud ja universaalsed funktsioonid üheks parajalt mugavaks ja praktiliseks tervikuks, pakkudes juba esmakohtumisest alates lihtsat kasutajakogemust. Sügava armatuuriga salong on täis kumeraid disaini, luues visuaalselt igati nägusa ja isegi kergelt sportliku ilmega terviku. Materjalide osas esineb küll enim plastikut, kuid üldiselt püsivad paneelid kenasti oma kohal ja ehituskvaliteet on oma klassis keskmisest parem.

Istmete osas saab Yaris Cross olenevalt varustusest kas tekstiil- või nahkkattega istmed, millest uhkeimad GR Sport varustuses ka pööratud nahaga. Testitud masin oli varustatud aga nahkistmetega, mis oma kergelt korvika kujuga hoiavad reisijaid piisavalt hästi paigal ning pakuvad, olenemata pigem jäikadest polstritest, toekat ja mugavat istumisaset. Istmete üldine asend on püstine ning rohke mehaanilise reguleerimise ulatus võimaldab mugava asendi leida igat kasvu reisijal. Mugavuse osas võiks aga nii uste, kui keskkonsooli käetoed veidi pehmemad olla. Esiistmed saavad standardist ka kaheastmelise soojenduse. Tagareas on istmed veidi jäigemad ja püstisema seljatoega, mille tõttu ka reisijatele natukene väsitavamad.

Ruumi osas esineb Yaris Cross võrdlemisi ootuspäraselt. Esireas võiks veidi rohkem ruumi olla juhi parema põlve ümbruses, kuid põhimõtteliselt mahuvad esiritta siiski kaks kahemeetrist kenasti ära. Pikiteljel on jalaruumiga nõnda, et kaks keskmist kasvu täiskasvanut mahuvad üksteise taha napilt ära, kuid kui ees sõidab kummalgi kohal kahemeetrine, mahub tema taha vaid põhimõtteliselt väikest kasvu laps. Pearuumi poolest mahuvad igale istmekohale ka kahemeetrised. Täiskasvanute jaoks muudavad masina tagumisele istmereale lähenemist raskemaks ka pigem kitsad ukseavad. Salongi atmosfäär on disainilt lihtne ja hubane, millele lisavad sportlikkust must laepolster ja üldine tume hõng. Samas pole salong aga tänu suurtele akendele ka liiga hämar ja sünge ning avaruse lisamiseks pakutakse mudelile ka panoraamkatust. Esemete hoiustamiseks on salongis väikesed uksetaskud, pigem väike kindalaegas, madal käetoe alune laegas, juhtmevaba laadijaga tasku käigukangi taga, topsihoidjad konsoolis ja süvis multimeedia all. Tagumine rida saab samuti väikesed uksetaskud ja topsihoidjatega käetoe, mis loob avatult ka ligipääsu pagasiruumile.

Pagasiruumi on Yaris Crossil 397 liitrit, mis jääb mahutavusega täpselt Volkswagen T-Crossi ja Škoda Kamiq’i pagasiruumide vahele, pakkudes seega oma suurusklassis arvestatavat praktilisust. Mugavuse poolest on pagasiruumi ava parajalt suur ja pagasi peale- ning maha laadimist lihtsustab pea olematu laadimiskünnis. Praktilisust lisavad kaks taskut külgedel, väike lisaruum põranda all ja haagid ruumi nurkades. Pikemate esemete vedamiseks klapivad uhkematel varustustel teise istmerea seljatoed kokku 40:20:40 suhtes ning uhkemad varustused saavad ka elektrilise pagasiluugi.

Multimeedia kuvamiseks saab Yaris Cross olenevalt varustusest 8- või 9-tollise puuteekraani, mis asetatud armatuurist väljaulatuvale paneelile, kenasti reisijate käeulatusse ja vaatevälja. Riistvaraliselt on ekraan väga terava pildiga ning opereerib meeldivalt kiirelt ja sujuvalt ning ka tarkvara poolel on Toyota teinud suure sammu edasi. Nimelt on Toyota arendanud uue operatsioonisüsteemi, mis omajagu kaasaegsema väljanägemisega ja loogilise ülesehitusega, pakkudes eestikeelsena läbivalt meeldivat ja selget kasutajakogemust. Funktsioonid ja sätted on lihtsasti leitavad ning kasutatavad ning süsteem tervikuna kasutajasõbralik. Helisüsteemi osas oli testitud mudel varustatud lisavarustuses pakutava JBL helisüsteemiga, mis esitab Yaris Crossi üllatavalt heas heliruumis palasid dünaamiliselt ja puhtalt. Kliimasätete jaoks on mudeli armatuuril eraldiseisev füüsiliste nuppudega kliimapaneel, mis üheselt mõistetav ja ka sõidu ajal lihtsalt kasutatav.

Sõiduandmete kuvamiseks saab mudel rooli taha umbes 8-tollise ekraani ja kolme analoogkellaga (energiakasutus, mootori temperatuur ja kütusetase) näidikutabloo, mis kenasti läbi rooli ava nähtav ning tänu süvistatud paigutusele ka välise valguse peegeldumise eest kaitstud. Tabloo digitaalne ekraan on piisavalt terava pildiga ning opereerib riistvaraliselt kiiresti. Tarkvara poolest on kuue põhivaatega süsteem väga infotihe ja kasutajasõbralik, kuid veidi vananenud visuaalse ilmega. Viimasest olenemata on aga info lihtsalt leitav ja süsteem lihtsasti kasutatav. Lisavarustuses pakub Toyota mudelile ka 10-tollise kuvaga esiklaasinäidikut, mis samuti terava pildiga ja informatiivne.

Rooli kohale saab Yaris Cross olenemata varustusest nahkkattega kolmekodaralise, mis olenemata proportsionaalselt pigem suurest läbimõõdust, püsib tänu ergonoomilisele disainile kindlalt käte vahel ning võimaldab ka erinevaid käsitsemise viise. Materjalide poolest on rool suuremas osas plastikust, kuid püsib kenasti kvaliteetselt koos. Multifunktsionaalsust lisavad rooli kummalegi kodarale asetatud 8 füüsilist nuppu, mida olenemata nuppude rohkusest, siiski tänu loogilisele asetusele ja reljeefsele disainile väga mugav ja lihtne kasutada. Parempoolsed kontrollivad peamiselt juhiabilisi, vasakpoolsed näidikuekraani ning multimeedia nupud on mõlema kodara alläärel. Hübriidne Yaris Cross saab standardist ka roolisoojenduse.